Милитиа начинает активные научные исследования андроидов ограниченной серии S. Эти андроиды совершенны по своей природе, так как их создатель - знаменитый на весь мир профессор Харди. Милитиа - это армия Земли, президент является непосредственно главнокомандующим Милитией. Главным местом действия станет город Эллар, или в, как его еще называют, 3ей Милитией. В город прибывает корабль с андроидом на борту. Этот андроид - девочка, хочет, чтобы её передали на анализ ученым Милитии, так как она содержит важную информацию относительно Албито. В свою очередь Албито начинают действовать. Албито считаются террористами, но они являются последними представителями Империи Зеон. Андроида сопровождает группа специалистов, но по дороге на них нападает двое Албито, в робокостюмах. героям приходится отбиваться вручную от нападок этих двоих и они вынуждены с боем прорываться к зданию Милитии. В это время прибывает бывший капитан Милитии и он, узнав о нападении, спешит помочь спасти андроида. В это время в дальних районах Земли начинает проявляться странная болезнь, от которой люди сходят с ума. В один их городов направляется отряд быстрого реагирования, так как там видели Ванзеров. Ванзеры - машины, что обладают разумом. Эти боевые машины готовы уничтожать все на своем пути ради выполнения своих целей. Отряд пропадает и в городок направляют особый отряд, состоящий их одного робокостюма с двумя пилотами на борту. Пока все это происходит, в 3ей Милитии появляется странный молодой человек, скорее даже юноша. его мотивы не понятны, но он в одиночку вступает в схватку с Албито и побеждает их, те вынуждены отступить. Но на этом парень не останавливается, он пытается захватить андроида, но получает отпор, завязывается драка, но в этот момент прибывает бывший капитан. Юноша вынужден отступить и продолжить схватку с капитаном в другом месте. Специалисты, вместе с андроидом, прибывают в штаб квартиру Милитии. После этого приходит известие о том, что был найден робокостюм капитана, он уничтожен, но пилот пропал. Собирается команда по поиску капитана. В ходе поисков, команда сталкивается с известным юношей, капитан по словам парня у него в заложниках, и он готов обменять его на андроида. Что будет дальше неизвестно, остальное решать Вам...

Автор сюжета: Акиро Юкио.